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Nature评论一篇:拟南芥的时代要结束了吗?

2010年3月11日 kunshanyu 没有评论

Plant biologists fear for cress project

Is enthusiasm withering for funding studies into Arabidopsis thaliana?

文中说到很多国家的基金已经开始限制对拟南芥研究资金投入,开始转向真正的作物研究,具体看文章。。。

分类: 新闻 标签:

[每周文献更新] 3.8-3.14 –>待续

2010年3月10日 et83214 没有评论
分类: 杂类项 标签:

PMID:20190735 胚顶端底部极性 转录因子

2010年3月9日 kunshanyu 没有评论

Nature ,8 February 2010

Control of Arabidopsis apical–basal embryo polarity by antagonistic transcription factors

我们知道细胞都有极性,胚更有apical–basal axis,将来会分化出shoot/root顶端分生组织,目前知道这种极性是由PLETHORA (PLT) genes所控制,这篇文章找到了PLT1 and PLT2所直接调控的转录共抑制子TOPLESS(TPL),并且利用TPL作为遗传材料,还找到了HD-ZIP III家族基因也起着重要调控作用,他们足可以使root pole into a second shoot pole,这篇文章说明了PLT and HD-ZIP III作为拮抗作用,调节着root and shoot poles的分化。这篇文章faculty1000给了9分,很高的评价,我就看了摘要,写的我自己都看不下去了。

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分类: 分子研究 标签:

[激辩] 粮食转基因:是“救星”还是“大患”

2010年3月8日 forestcat 3 条评论

来源:第一财经日报—转载自科学网   原文链接

2009年底,农业部向两种转基因水稻和一种转基因玉米颁发了安全证书,更早的2008年,农业部门启动了总额约200亿元人民币的转基因生物新品种培育科技重大专项,据称为培育一批抗病虫、抗逆、优质、高产、高效的重大转基因生物新品种,提高农业转基因生物研究和产业化整体水平,为中国农业可持续发展提供强有力的科技支撑。

国内转基因研究的如火如荼并没有平息国内外专家学者争论的声音,在国外研究者发出转基因技术其实是西方在控制中国粮食命脉的警告时,从事以及接近转基因技术的一些国内专家却意外保持沉默。但是云遮雾罩的转基因技术研究背后,仍然有一些线索可供普通人玩味思索。

转基因大米比饮用水还安全?

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分类: 新闻 标签:

[资源分享] 浙江大学生物信息学札记

2010年3月6日 et83214 没有评论

感谢forestcat的分享:

包括8章的中文札记内容+ NCBI植物genome的汇总链接 + 全部或部分基因组已测序完成的物种汇总 +主要分子生物信息数据库

一并打包。下载点我

分类: 软件工具 标签:

Nature强评述一篇,不得不推荐

2010年3月4日 et83214 2 条评论

Do scientists really need a PhD?

Young scientists at a Chinese genomics institute are foregoing conventional postgraduate training for the chance to be part of major scientific initiatives. Is this the way of the future?

—–以下为科学网评论—–

文章说,不同国家间研究生培养模式存在差别。美国和欧洲长期以来认为,学生需要完成多年 的研究生训练后才能全职加入产业界或学术界最重要的研究。而在亚洲,科学界倾向于重视定向的、应用性研究。比如在日本,产业界获得的科研预算比例 要远高于西方,那儿的管理人员也经常说他们更喜欢大学本科生,可以在公司内部训练。结果,对于学术研究生训练就强调得较少。这种方法最极端的例子要属 BGI。就在今年,已经有大约500名大学毕业生签约了BGI,在夏天毕业后,他们就将开始在BGI的测序工作。

就《自然》看来,BGI的这些研究人员聪明而自信,年轻却极为有经验。但他们中却很少有 人计划进行研究生学习。那么,这些“发育”中的科学家如此一心一意地聚焦于测序技能,会不会让他们自己吃亏?西方模式的研究生学习最终会让他们变得更具想 象力和创新力吗?文章表示,答案并不明晰,这种模式也许真的能够产生未来的有活力的领导人物。

文章最后说,考虑到西方学术培养不断增加的严格程度和时间长度,BGI模式也许值得认真 的考虑。从某个角度来说,它只是类似美国国家科学基金会针对本科生的“科研经验”项目激进而合理的延伸,而且“科研经验”项目已经证明年轻学生能够有效地 加入实践研究,并作出贡献。如果BGI能够取得成功,那么它对于基因组学创新性方法和教育及培养来说都将是一个典范。

分类: 新闻 标签:

[每周文献更新] 2010.3.1-3.7

2010年3月2日 et83214 没有评论

1.  Curr Opin Plant Biol.

-> Plastid transport and metabolism of C(3) and C(4) plants-comparative analysis and possible biotechnological exploitation.

C3,C4作物质体运输的差别比较,以及在生物工程中的可能应用。

2.  Annu Rev Plant Biol.

-> Genetic and Molecular Basis of Rice Yield.

邢永忠,水稻产量的基因分子基础,综述。

-> Arsenic as a Food Chain Contaminant: Mechanisms of Plant Uptake and Metabolism and Mitigation Strategies.

砷作为食物链污染物:植物吸收,代谢和减灾对策。

-> Histone Methylation in Higher Plants. (27M,请耐心下载)

曹晓风,高等植物组蛋白甲基化综述。

3. Proc Natl Acad Sci

-> Phosphoenolpyruvate carboxylase intrinsically located in the chloroplast of rice plays a crucial role in ammonium assimilation.

磷酸羧化酶在水稻叶绿体形成中的作用。

4. J Exp Bot.

-> Glyoxylate rather than ascorbate is an efficient precursor for oxalate biosynthesis in rice.

乙醛酸比抗坏血酸更能作为水稻草酸合成的前体物质。

5. Plant Cell Rep.

-> Fertility restoration by Ifr1 in rice with BT-type cytoplasmic male sterility is associated with a reduced level, but not processing, of atp6-orf79 co-transcribed RNA.

似乎是BT型细胞质雄性不育的一些机理研究,看到这种题目就困,忽略……

6. TAG

-> Identification of a second major resistance gene to Rice yellow mottle virus, RYMV2, in the African cultivated rice species, O. glaberrima. [暂无全文]

非洲栽培稻中鉴定到的水稻黄斑驳病毒抗性基因,RYMV2。

-> Deleterious amino acid polymorphisms in Arabidopsis thaliana and rice. [暂无全文]

拟南芥与水稻中的“有害氨基酸多态性”(?)

7. Plant and Cell Physiology

-> Analysis of the Rac/Rop Small GTPase Family in Rice: Expression, Subcellular Localization and Role in Disease Resistance 【未排版】

小GTP酶家族在水稻中的表达和作用。

-> Cytoplasmic-Nuclear Genomic Barriers in Rice Pollen Development Revealed by Comparison of Global Gene Expression Profiles among Five Independent Cytoplasmic Male Sterile Lines 【未排版】

五个独立的细胞质雄性不育系进行的基因表达谱分析比较。

8. Plant J.

-> ZEBRA-NECROSIS, a thylakoid-bound protein, is critical for photoprotection of developing chloroplasts during early leaf development. [暂无全文]

叶片早期叶绿体光保护的某蛋白。

-> Transcriptome-wide identification of microRNA targets in rice. [暂无全文]

水稻miRNA所作用的转录本的鉴定。

9. New Phytol

-> Expression analysis and functional characterization of the monosaccharide transporters, OsTMTs, involving vacuolar sugar transport in rice (Oryza sativa).

水稻液 泡单糖转运子OsTMTs的表达分析和功能研究。

分类: 文献-水稻 标签:

PMID: 20190078 细胞周期 稻瘟病 附着胞

2010年3月1日 kunshanyu 2 条评论

Plant Cell Advance Online Publication
Published on February 26, 2010; 10.1105/tpc.109.072447

Cell Cycle–Mediated Regulation of Plant Infection by the Rice Blast Fungus

我们知道稻瘟菌在侵染水稻过程中会产生附着胞,附着胞的产生与细胞周期有着紧密的联系。在这篇文章中,作者发现附着胞的形成是由一个DNA replication-dependent checkpoint所起始,突变Never-in-Mitosis 1 gene,导致其DNA合成受到破坏,会阻止芽管从新生的侵染结构中产生。附着胞的细胞分化需要进入有丝分裂时期,在nimA temperature-sensitive mutants中,不能进入有丝分裂时,就不能产生有功能的附着胞。当进入有丝分裂以后条件性失活Blocked-in-Mitosis 1 gene or expression of stabilized cyclinB-encoding alleles基因时,附着胞的分化不受到影响,但是这些细胞不能进入植物组织中。综上所述,这些数据表明,附着胞导致的植物侵染与三种不同的cell cycle checkpoints有联系,且对植物的致病所必须。

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分类: 抗性相关 标签:

[每周文献更新] 2010.2.22-2.28

2010年2月28日 et83214 没有评论

本来以为可以多攒几篇一起发的,结果还是只有一篇,囧。

The Plant Journal Published Online: 27 Jan 2010

Receptor-like kinase OsSIK1 improves drought and salt stress tolerance in rice (Oryza sativa) plants

OsSIK1增强水稻对于干旱和盐害的抗性。

ISAAA 年度生物技术/转基因年度总结

2010年2月25日 et83214 没有评论

2009年全球生物技术 / 转基因作物商业化发展态势

来自ISAAA [International Service for the Acquisition of Agri-biotech Applications]

现在关于转基因的争论实在太多……

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不好意思,英文的下载错了,新地址

分类: 新闻 标签: